无论因何种原因造成体内叶酸缺乏，其直接的后果就是细胞的分裂和增殖受到影响，这在血液系统则表现为血红蛋白合成减少，红细胞不能成熟而产牛巨幼红细胞性贫血。患巨幼红细胞贫血的孕妇易出现胎儿宫内发育迟缓、早产儿及新生儿低体重等。
如在妊娠早期缺乏叶酸，则会影响胎儿大脑和神经系统的正常发育，由于神经管闭合是在胚胎发育的第3～4周，此时严重缺乏叶酸将造成无脑儿和脊柱裂等先天畸形，也可造成因胎盘发育不良而引起流产、早产等。
缺乏叶酸，除了会造成先天畸形儿外，还会给孕妇带来危险。孕妇将会出现贫血症状，严重时还会导致贫血性心脏病、妊娠期高血压疾病、先兆子痫、胎盘早剥等。
